Вероятностный и информационный анализ результатов измерений на Python

[fediq]

Диаграммы полностью идентичны, ...

Диаграммы не идентичны. Обратите внимание на бины в районе 1.0. Видно, что функция hist() размещает в единице правую границу бина, ваша же функция размещает его центр. Из-за этого на вашем графике появляется лишний бин, а высота предшествующего ему бина оказывается ниже на один пункт.