Если вы не понимаете, как ваша программа попадает из FLASH в RAM, значит, вы не контролируете свой микроконтроллер. Здесь не будет кнопок «Generate Code». Только чистый Си, суровая разметка памяти и запуск STM32 с полного нуля. Хардкор, как он есть.