> (под словом вики в этой статье подразумевается исключительно MediaWiki)
Например, для DokuWiki тоже есть соответствующие плагины для построения диаграмм: ditaa, diagram (http://nikita.melnichenko.name/projects/dokuwiki-diagram/) и др.
Мы много лет используем Graphviz и другие типы семантических графов в наших MediaWik-ах (а также в автогенеримой документации и т.п.). lib.custis.ru/Graphviz
Хочу поделиться еще одним интересным использованием GraphViz. Проект canviz занимается отрисовкой этих графов прямо на Canvas из Javascript. Соответственно, с ним GraphViz можно использовать где угодно, где есть возможность вставлять свой Javascript.
Плюсую вам всем карму и забираю в закладки статью. Когда-то при изучение алгоритмов сжатия, увлекся хаффманом. Дерево тоже строил, но визуально оно сложно воспринималось. Будет время, исполню свою маленькую мечту.
Ещё есть PlantUML, Java-приложение, требующее Graphviz для работы. Всякие диаграммы классов с ним создавать проще, чем с GraphViz. Умеет интегрироваться с MediaWiki, trac, Redmine и кучей всего, включая MS Word и OpenOffice.org / LibreOffice Writer
Non-WYSIWYG диаграммы в вики