В итоге у меня так и не получилось запустить всё с flex_sdk_4.9, но с 4.6 всё работало хорошо, за исключением, что я так и не смог настроить copy-flex-resources и wrapper, чтобы весь результат сборки сложить основному проекту.
Как там ситуация сейчас не знаю, был релиз, говорят с flex_sdk_4.9 работает, но я пока не пробовал, собираю всё на IDEA. =\
Нашел ее раньше. Хотелось повторить путь, который проделывал в java, там уж больно хорошо было. Maven самодостаточный инструмент, хотелось получить от этого профит, ан не вышло. Не очень хотелось использовать что-то еще, для теста. Для эксперимента этого достаточно, если бы стояла задача «сделай или умри», то попробовал бы и это. С 4.6 у меня тоже получилось. Ставил своей целью выбрать инструмент для сборки. Для flex maven пока не мой выбор. Можно, но мой. А за ссылки спасибо.
Сборка flex проекта с использованием maven