Увы, похоже я не по тем ключевым словам искал в поиске на хабре подобные статьи, потому что в тот момент ничего не нашел толкового и решил описать свой опыт. В любом случае может здесь найдутся пользователи этого приложения и им эта статья сможет помочь.
Модификация исходного кода android-приложения с использованием apk-файла