Как ИИ секвенирует геном всех известных организмов

[aamonster]

Разве упирается в обсчёт данных, а не в их получение (собственно, процесс "отщипывания" кусочков ДНК с выяснением, что же мы отщипнули)? Не вижу, как тут может помочь ИИ – тут надо тупо больше "пробирок".

[MisterClever]

В статье приведены два раздела, с названием инструментов: Deep Variant и Deep Polisher которые и описывают, как именно ИИ помогает в процедуре

[aamonster]

Я понимаю, как помогают. Я не понимаю, как обойти предел производительности HTS-систем.

[MisterClever]

Ааааа, если в этом плане, то да, пока еще это затруднительно. Но кто знает, может сами наработки нейросетей помогут нащуать более эффективную процедуру секвенирования. Или снять часть нагрузки с ученых, чтобы те добрались до иных принципов

[ArtFrost]

Пардон, не совсем понял, описанные нейросети помогают именно полностью секвенировать весь геном начиная с секвенатора при чтении нуклеотидов или помогают собирать из ридов уже полученных сырых данных контиги и конечные хромосомы ? Если второе, то есть где-то открытая база с этими raw data ?

[MisterClever]

Видимо, второе) Но вот где открытая база я не знаю(

[shadrap]

конечно. основной труд это сборка и анотирование. все референсные геномы находятся на серверах ncbi - национальный центр биоинформации США. доступ открытый.

[asantat]

Никак. Секвенируют люди. Собирают пока тоже люди с помощью алгоритмов. Машинное обучение, которое может использоваться в качестве инструментов на этапе бейсколлинга, полировки или анализа вариантов - это не искусственный интеллект. Автор не понимает, что пишет и о чем. Но понятно, зачем - скорее всего, хайпануть на теме ИИ. А по факту - получить заслуженные минусы. Жаль, у меня рейтинг не позволяет тоже ставить минусы.