За такие, в теории, не должен, потому что фактически скрипт выполняет jvm, и байткод приложения не модифицируется, в отличие от подгрузки классов через ClassLoader.
Т.е. приложение с таким встроенным скриптовым движком, как бы уже содержит в себе все возможные варианты использования скрипта
Гармония скриптов внутри Android приложения