Всем понемногу — и докингом тоже, и виртуальным скринингом и молекулярной динамикой… но дома это баловство, основная масса расчетов на кластере, на котором бАААльшие очереди.
:) Моя небольшая сумасшедшая мечта — это NVIDIA Tesla, можно заполучить кластер за 300 тысяч деревянных, при такой что закачаешься — скоро высокоемкие расчеты можно будет делать дома, на своем маленьком персональном кластере. Беда только, софта пока мало, но ниша активно заполняется. Кванты, молекулярная динамика, обещают уже молекулярный докинг, есть несколько пакетов SVM, ANN. Вообщем за GPU будущее…
Браво! а вы часом не биоинформатик?
задумался… было бы интересно написать статью или даже просто сводную таблицу, сравнивающую компьютерные термы програмирования и аналоги в молекулярной биологии
Хм :)
в области хемо и биоинформаткии сейчас очень большая проблема с семантикой, которая должна использоваться для описания любых если не всех биологических и химических процессов. Из огромного стэека бесполезной/полубесполезной информации с ее помощью структурируют инфорамцию. Думаю, что от древа тэгов никуда не денешся.
Да, SmartBrowser в качестве плагина для лисы был бы очень полезен, единственно не понимаю зачем Микрософту спонсировать разработку — не думаю что им это выгодно.
А количество плагинов для лисы, позволяющих настраивать вид страницы огромно, вот только для автоматического клинапа нашелся только один — Clean the junk — https://addons.mozilla.org/ru/firefox/addon/13193
перевод новости крайне простой — показан процесс формования синапсов, процесс изученный, и постоянно изучаемый, но реально здесь показано образование «цикла», который (ДА) является памятью. Память хранится НЕ на молекулярном уровне, а надмолекулярном из таких вот простых циклов (в этом и есть прорыв). А изучение мозга идет двунаправленно — на молекулярном уровне — рецептора, ферменты, малые молекулы (биохимия, молекулярная биология....) и «физиологическом» уровне — это область неврологии (Neuroscinces), в последнее время стали активнее совмещать эти области — это область системной биологии, которая может выступать (а) на молекулярном уровне, (в) внутри и межклеточном, (г) тканевом, (д) собственно весь организм.
Так что закачка информации в мозг будет оооой как не скоро :) но помечтать уже можно, если осторожно
К сожалению не смог найти оригинальную статью, но она где-то в Science.
Я просто сужу по своей тематике — часть журналов по химии и биохимии не издаются на английском языке и соответственно не индексируются иностранными поисковыми и «научными» системами — PubMed, Scopus и тд
Если NIGMA позиционирует себя как интелектуальный поисковик, то думаю, что химические реакции, это не то чем бы им следовало заниматься :)
Почему? смысла в этом на 2 копейки…
а вот сделать реальную поисковую систему по академически журналам россии, или по российским научным персоналиям — это другое.
Так что простите — химические реакции это хорошо, но пользы этому нет
Было бы хорошо иметь настраиваемое количество прямоугольников с задаваемым именем. статистика в виде
Задача1 5 часов 10 мин
Задача2 2 часов 20 мин
Хрень1 4 часа
меня вполне устроила
www.pdb.org/pdb/static.do?p=/Viewers/RCSBViewers/viewer_start.jsp&viewerType=SV&structureId=2WH1&unit=bio&unit_id=1
Предупреждение: Сначала придется скачать ява апплет + структуру самой рибосомы нехилого размера, но кому интересно тот дождется
я как раз думал о том чтобы протестить powerizer — сделайте такой-же по Москве — цены ему не будет.
Молекулярный докинг
Математические расчеты
Квантовая химия
задумался… было бы интересно написать статью или даже просто сводную таблицу, сравнивающую компьютерные термы програмирования и аналоги в молекулярной биологии
в области хемо и биоинформаткии сейчас очень большая проблема с семантикой, которая должна использоваться для описания любых если не всех биологических и химических процессов. Из огромного стэека бесполезной/полубесполезной информации с ее помощью структурируют инфорамцию. Думаю, что от древа тэгов никуда не денешся.
А количество плагинов для лисы, позволяющих настраивать вид страницы огромно, вот только для автоматического клинапа нашелся только один — Clean the junk — https://addons.mozilla.org/ru/firefox/addon/13193
:)
перевод новости крайне простой — показан процесс формования синапсов, процесс изученный, и постоянно изучаемый, но реально здесь показано образование «цикла», который (ДА) является памятью. Память хранится НЕ на молекулярном уровне, а надмолекулярном из таких вот простых циклов (в этом и есть прорыв). А изучение мозга идет двунаправленно — на молекулярном уровне — рецептора, ферменты, малые молекулы (биохимия, молекулярная биология....) и «физиологическом» уровне — это область неврологии (Neuroscinces), в последнее время стали активнее совмещать эти области — это область системной биологии, которая может выступать (а) на молекулярном уровне, (в) внутри и межклеточном, (г) тканевом, (д) собственно весь организм.
Так что закачка информации в мозг будет оооой как не скоро :) но помечтать уже можно, если осторожно
К сожалению не смог найти оригинальную статью, но она где-то в Science.
Не понял правда при чем здесь SCIgen…
Почему? смысла в этом на 2 копейки…
а вот сделать реальную поисковую систему по академически журналам россии, или по российским научным персоналиям — это другое.
Так что простите — химические реакции это хорошо, но пользы этому нет
Задача1 5 часов 10 мин
Задача2 2 часов 20 мин
Хрень1 4 часа
меня вполне устроила