Видимо после перепрошивки линии порта JTAG-A переопределяются на другое функциональное назначение, хотя в программе порт B на котором находится JTAG-A даже не инициализировался. Разбираться в этом не хотелось, так как есть еще и JTAG-B.
В файле MDR32F9Qx_config.h выберите #define USE_JTAG_A
Можно проще перейти в файл с настройками: ctrl+shift+P -> Open settings (JSON)
В файле MDR32F9Qx_config.h выберите #define USE_JTAG_A
А назовите еще игру, где большой выбор антисоциальных действий. Кроме других продуктов рокзвезд ничего в голову не приходит.
Видел ваше письмо на КМЗ. Ну как, ответили что-нибудь?