В Services попадают только те типы конфигураций, которые укажет пользователь, для Spring Boot конфигураций, когда их становится больше одной, IntelliJ IDEA показывает всплывающую подсказку с предложением поместить их в Services, а так список типов можно найти в Edit Run/Debug Configurations диалоге, выбрав справа нод Templates: Configurations available in Services.
да, для задачи в окне Maven можно создан run конфигурацию (пункт Create 'name'… в контекстном меню) и потом запускать именно ее, или убрать Maven run конфигурации из списка отображаемых в Services.
Добрый день, нет смысла в том, чтобы пустое окно постоянно висело. Мы планируем в следующих версиях сделать возможным настраивать доступные сервисы в самом окне, в частности доступные в окне Services run конфигурации, тогда будет иметь смысл то, что окно доступно всегда. Сейчас конфигурации для Services настраиваются так: www.jetbrains.com/help/idea/services-tool-window.html#run-configs
Какой тип run конфигурации у Вас настроен для «Jersey-сервиса»?
В настройках Keymap можно настроить шорткат для любого tool window.
И всегда можно использовать Switcher (Ctrl+Tab) для переключения между открытыми редакторами и окнами инструментов.