Работа над Codeception продолжается, но многое из того, что вы перечислили уже поддерживается. Отдельные тесты и кейсы уже можно запускать — кликните правой кнопкой на методе и выберете Run или в Run Configuration выберете Method. Тесты внутри Docker контейнера тоже подерживаются — www.youtube.com/watch?v=UuiLnmWMvv0.
Голосуйте за поддержку code coverage в Codeception — youtrack.jetbrains.com/issue/WI-34962 и за обновление — youtrack.jetbrains.com/issue/WI-25513.