Почему не Object.Instantiate?

А почему бы и нет.

Разберемся, что такой Object.Instantiate.

Обратимся к официальной документации Unity.

Эта функция создает клон объекта аналогично команде «Дублировать» в редакторе.

Instantiate(Object original);

Создание клона объекта крайне затратный по ресурсам. Измерения будут проводиться с помощью Stopwatch.

С использованием Instantiate:

void CubeInPosInstantiate()
{
			GameObject obj = Instantiate(Cube);
			obj.transform.position = new Vector3(1.25f, 0f, 0f);
}

И простым присвоением новой позиции:

void CubeInPosTransform()
{
			Cube.transform.position = new Vector3(1.25f, 0f, 0f);
}

Переместить готовый Куб очевидно будет быстрее чем создать новый и переместить его.

Рассмотрим более наглядный пример. Будем перемещать куб по оси Х и в последствии возвращать его обратно.

В среднем на выполнения уходит 0.08616ms. Попробуем сделать тоже самое, но удалять и создавать новый объект для каждого цикла перемещения. Для чистоты эксперимента создадим Prefab нашего Куба.

tempCube = Instantiate(Cube);

В среднем на выполнения уходит 1.3978ms. Что по сравнению с перемещением выглядит грустно. Естественно сложнее всего приходится при удалении объекта, бросить мы его там не можем. Посмотрим график.

Скорость выполнения кода для перемещения куба в 16.223 раза быстрее, чем для создания его клона. При измерении в 1 итерацию мы получили разницу в 2.43 раза, но на дистанции разница уже более очевидна.