Комментарии 72
P.S. Не все тут читали школьный учебник биологии, и я в том числе)
всю абсурдность споров на тему ГМОЭто вопрос скорее социальный, чем биологический. В спорах его часто относят к биологическим исходя из здравого смысла и названия (и это ошибка в случае с ГМО), а на самом деле это так называемый социальный артефакт с «фальшивым обоснованием». То есть «фальшивое обоснование» — опасность генетической модификации, но фактически делается правильный вывод об опасности/вредности продуктов с ГМО никак не относящийся собственно к самой модификации. Последовательность превращений следующая: оказалось, что часто генной модификации подвергалась соя. А сою часто применяют недобросовестные производители как суррогат мяса. И выкидывают на рынок опасную «мясную» продукцию с избытком подмешанной сои. Помимо просто обмана с содержанием мяса в продукте при избытке добавленной сои, соя дает растительные женские гормоны ведущие к феминизму, импотенции и лишнему весу. Возникают сосики, сардели, колбаса, где часто подмешивают сою подвергшуюся ГМО. Вот и появляются опасные продукты содержащие ГМО, опасность которых совсем не в модификации генов.
А еще есть факты злоупотребления технологией ГМО. Например, вечнонедозрелые твердые томаты со вкусом травы, которые вытеснили во всех магазиных и ресторанах в российских городах нормальные томаты. Это и есть последствия неконтролируемого рынками (скрытого) применения ГМО. То есть снова это проблема как бы не самого ГМО, но оказалась прочно переплетена с ГМО на недоразвитых рынках. Нечто похожее происходит в этой стране и с прививками.
Возникают сосики, сардели, колбаса, где часто подмешивают сою подвергшуюся ГМО. Вот и появляются опасные продукты содержащие ГМО, опасность которых совсем не в модификации генов.А без ГМО в эти мясные продукты меньше сои что-ли будут добавлять?
женские гормоны ведущие к феминизму
Вот откуда они берутся, а я-то думал…
Там такая проблема стоит, но её источник, на мой взгляд, в другом, из-за снижения стоимости томатов по отношению к уровню доходов, поставщики не могут себе позволить высокого уровня "утряски", поэтому эти самые томаты собирают в зелёном виде.
А еще есть факты злоупотребления технологией ГМО. Например, вечнонедозрелые твердые томаты
Злоупотребление видимо в том, что для томатов (коммерчески пригодной) технологии ГМО пока не разработали и приходится довольствоваться плодами селекции ?
«Тайная жизнь клетки» — прекрасный фильм, там даже почти не врут, а моторные белки получились вообще исключительно. Но, чтобы понять, что там вообще происходит и почему скорее всего так, надо вспомнить школьную биологию и прослушать пару-тройку спецкурсов.
Всегда было интересно, как происходит исследование процессов на таком мелком уровне. Ведь эту биохимию не так просто разглядеть в микроскоп?
При помощи каких технологий это делается? Это было бы ближе к формату Хабра, чем учебник биологии.
А биохимию исследуют химическими методами, но там все очень не просто из-за того, что очень много веществ и очень много реакций происходит одновременно.
Широко используется электрофорез и хромотография для разделения смеси молекул.
Рибосома 30 нм…
Я правильно понимаю что на таких размерах уже начинают действовать квантовые эффекты?
Веди по сути это молекулярный сборщик РНК программа (типа такая перфолента) и из аминокислот собирает белки.
Как как это вообще работает? Ученые только мечтают о молекулярных ассемблерах )
Окей, гугл, покажи мне фильм "Тайная жизнь клетки"
Есть специальные антенны, состоящие из молекул пигментов, которые поглощают свет. Энергия поглощенных фотонов вызывает электронное возбуждение, которое передается в реакционный центр. Так вот, молекулы пигментов находятся на крайне малом расстоянии, 1-3 нм и вот тут, при передаче энергии от пигментов к реакционным центрам начинают действовать квантовые эффекты.
По сути да, как работает я постараюсь написать, простым языком (с фокусом на регуляции процесса)
С одной стороны понятно, что для понимания неплохо бы ознакомится и с физикой и с химией и может еще с чем, и на каждом этапе детализации черпать знания из соответствующей дисциплины, но как же хочется найти популяризатора, способного ответить на твои обывательские «как и почему?» вплоть до глубины «а на это наука пока не может дать четкого ответа». Примером такого объяснения служит ролик на ютубе «Ричард Фейнман — Магниты и вопросы почему?»
У меня, наверное, глупый вопрос, но как обывателю интересно знать, как так получается, что из одной зародышевой клетки в результате многократного деления вроде бы как на одинаковые клетки, возникают руки ноги органы? Ведь интуитивно напрашивается возникновения некой простой группы одинаковых клеток. И если это так, то как каждая клетка «решает» дифференцироваться в тот или иной тип, чтобы в результате руки ноги были на месте, а сердце слева?
В разделе «Детские вопросы»: «Как клетки понимают, что одни должны стать волосами, другие костями, третьи мозгами и т. п.? И из какого центра подается команда?»
В новостном разделе для взрослых: «Эмбриональные клетки вычисляют свои координаты математически оптимальным способом»
Красивые показательные фото про градиенты экспрессии генов зародыша есть в статье «Составлена самая подробная карта экспрессии генов в эмбрионе дрозофилы»
Что любопытно, статья на эту тему есть даже на Хабре: «Генные сети, управляющие строением тела животных»
Это как эпициклы и законы Кеплера.
На примере с языком — генетика — морфемный и лексический уровень, а эпигенетика — это синтаксический и стилистический.
Собственно, и с генами так же — реализовать крыло например можно совершенно разными генными сетями.
что эпигенетика — это некоторые специфические аспекты реализации генетических программ
В том-то и дело, что нет никаких «генетических программ» в отрыве от эпигенетики. Есть репозиторий, из которого скачивается и собирается то, что нужно в данный момент. А что именно нужно — это репозиторию неизвестно. Эпигенетика это не только знаки препинания, хотя и казнить нельзя помиловать как нельзя более удачный пример, эпигенетика это гораздо большее. Просто мы пока только в начале пути познания этого большего.
Греческий префикс epi- в слове, подразумевает факторы, которые влияют «поверх» или «в дополнение к» генетическим, а значит эпигенетические факторы воздействуют вдобавок или помимо традиционных генетических факторов наследственности.Знание законов Кеплера полностью отменяет необходимость знания эпициклов. Изучение эпигенетики никак не отменяет необходимость изучения генетики.
Наиболее часто использующееся в настоящее время определение эпигенетики было введено А. Риггсом (Arthur D. Riggs) в 90-х годах XX века и формулируется как «изучение митотически и/или мейотически наследуемых изменений в функции генов, которые не могут быть объяснены изменениями в последовательности ДНК»
Эпигенетика — именно дополнение к генетике, а не волшебная кнопка «сделать всё зашибись». Генетическая программа без проблем может выполняться и без использования эпигенетических факторов типа метилирования или деацетилирования гистонов. Они помогают получить разные фенотипы из одного генотипа, но базовый фенотип существует в любом случае. То есть, эпигенетические маркеры по определению не добавляют к геному информацию, они только меняют эффективность применения имеющейся. Именно как знаки препинания и диакритики.
Вы когда пишете «генетическая программа», что имеете в виду, можете раскрыть? И вот на примере статьи на хабре по вашей же ссылке про нейронные сети, как программа развития в принципе может быть реализована без эпигенетических механизмов? Каждая клетка имеет одинаковый код, но выполнить нужные его места можно только с помощью эпигенетики.
Собственно, дело не в названии же. Код ДНК переводится в структуру белка, это традиционная генетика. Как это делается — генетика знает. А вот почему выполняется именно нужный код — традиционная генетика ответа дать не может, это следующий уровень, частично на который сейчас отвечает то, что называют эпигенетикой.
Одним из примеров эпигенетических изменений у эукариот является процесс клеточной дифференцировки. Во время морфогенеза плюрипотентные стволовые клетки формируют различные полипотентные клеточные линии эмбриона, которые в свою очередь дают начало полностью дифференцированным клеткам. Другими словами, одна оплодотворённая яйцеклетка — зигота — дифференцируется в различные типы клеток, включая: нейроны, мышечные клетки, эпителий, эндотелий сосудов и др., путём множественных делений. Это достигается активацией одних генов и, в то же время, ингибированием других с помощью эпигенетических механизмов[3].
Ну и извините, «та же самая генетика» о влиянии гравитации, температуры и электромагнитных полей на экспрессию генов просто умалчивает.
Вы ставите телегу впереди лошади. Без генома не важно, какие у вас условия, и если у вас нет генов, позволяющих клетке функционировать как клетка печени, никакие эпигенетические механизмы не заставят её стать клеткой печени. Они позволяют сделать выбор, но вы не можете делать его при отсутствии вариантов.
Создать систему всегда труднее, чем ею управлять, и отметать «создающую» генетику, пытаясь выехать на одной «регулирующей» эпигенетике — крайне близорукий подход.
Не нужно приписывать мне утверждения, которых я не делал. Я нигде не говорил про «отмену» генетики. Так что ваши рассуждения мимо кассы.
Без генома не важно, какие у вас условия, и если у вас нет генов, позволяющих клетке функционировать как клетка печени, никакие эпигенетические механизмы не заставят её стать клеткой печени
Без генома нет возможности синтеза белков как такового, так что само собой, говорить об эпигенетике не приходится. Но клеткой какой ткани стать, решают именно эпигенетические механизмы. Я даже не понимаю, что вас заставляет отрицать очевидные вещи, которые по вашим же ссылкам и написаны.
Например, если взять мышиный ген, который включает подпрограмму образования глаза у мыши, и заставить его работать в зачатке ноги у мухи, то на мушиной ноге начинает формироваться глаз. Правда, не мышиный глаз, а мушиный.
Ну если в общем, то на смену генетике пришла эпигенетика.
Нет, не в дополнение, уровень выше.
Это как эпициклы и законы Кеплера.
Я нигде не говорил про «отмену» генетикиМне кажется, вы сами себе противоречите.
2. «Я вам, мягко говоря, тактично указал на ваше заблуждение, а вы мне лекции читаете? Ну, здорово.» (с)
3. Не существуют «мышиные» и «мушиные» гены, «гены глаз» и «гены ног» — существуют белки, которые могут или не могут выполнять определённые функции. Не знаю, к чему была эта ваша цитата.
4. Эпигенетика — один из разделов генетики, работающий только в комплексе с другими. Я просто указываю вам на неуместность заявления, что один раздел может «придти на смену» другому, если они работают только вместе. Это ваше заявление искажает картину работы отрасли, и в умах непрофессионалов может причудливо мутировать.
Мне кажется, вы сами себе противоречите.
А мне так не кажется. Я вполне раскрыл свою позицию в других фразах, вами не процитированных.
2. Могу повторить
Дифференциация тканей к эпигенетике отношения не имеет.
Одним из примеров эпигенетических изменений у эукариот является процесс клеточной дифференцировки.
3. Цитата не моя, а из статьи, которую вы привели как источник знаний для интересующегося человека, т.е., я предполагал, что вы знакомы с ее содержанием, и вполне вероятно, не имеете к нему возражений.
Ваша фраза
если у вас нет генов, позволяющих клетке функционировать как клетка печени, никакие эпигенетические механизмы не заставят её стать клеткой печенирасходится с текстом рекомендованной вами статьи.
4. Говоря «пришла на смену», я имел в виду на смену роли лидирующей отрасли научных знаний, способной дать ответы на вопросы, найти которые в рамках старой парадигмы не представлялось возможным.
Хотя они безусловно и работают вместе, и эпигенетика не работает без генетики, я не согласен с тезисом, что эпигенетика — один из разделов генетики. Можно конечно все впихнуть под одно название, но для меня грань проходит по собственно ДНК — есть изменения последовательности нуклеотидов — генетика, нет изменений — не генетика.
И вы так и не ответили, что понимаете под «генетической программой». А то я загуглил, результаты впечатляющие. Если вы из этих, то так и скажите, и останемся при своих.
2. На счёт того, считать ли ненаследуемые изменения эпигенетикой, специалисты расходятся, вы же сами видели разные определения. «Эпигенетические механизмы» не обязательно используются именно в рамках эпигенетики, использование уравнений же не делает физику математикой.
3. Цитата не противоречит моим словам ни капли: в генетическом коде и мухи, и мыши содержатся сходные последовательности генов, формирующие белки, необходимые для построения глаз. Поэтому управляющий ген одной смог запустить транскрипцию подходящих (или даже совпадающих) генов у другой. А вот светиться вы бы мышь не заставили, применив к ней любой эпигенетический метод, заставляющий светиться мошку с внедрёнными генами люминисценции.
4. Генетическая программа — это то, как ген выполняет свои функции, неужели это не очевидно? Где в моих словах вы нашли признаки такого вот клинического идиотизма? Или вам просто нравится оскорблять собеседника?
2. Ну и к чему этот пассаж? Вы либо действительно глубоко заблуждаетесь, либо крайне неудачно выразились, и к чему теперь это словоблудие? Ваше утверждение про дифференцирование явно расходится с практикой.
3. Белки для глаза мухи и глаза мыши нужны несколько разные, не находите? А насчет свечения мыши — вы намекаете, что если в геноме мыши нет гена для синтеза люциферазы, то и эпигенетикой светиться мышь не заставишь?
4. Абсолютно неочевидно. Один ген? У одного гена «программа» одна — полипептидная цепь. Вы писали
Генетическая программа без проблем может выполняться и без использования эпигенетических факторов типа метилирования или деацетилирования гистонов.. А откуда «программа» знает, что ей делать — выполняться или нет? Как ген выполняет свои функции, как раз и зависит от эпигенетических механизмов. И чем сложнее организм, тем больше роль эпигенетики. Это у прокариот все гены по умолчанию активны, а у нас наоборот, 90% кода закомментировано.
А «генетическая программа» — это фраза-маркер, знаете ли. Используете маргинальный жаргон — так чего потом обижаться?
4.
У одного гена «программа» одна — полипептидная цепь.Вы не знаете о регуляторных (функциональных) генах?
у прокариот все гены по умолчанию активны, а у нас наоборот, 90% кода закомментировано.«Закомментировано» — это вы про метилирование? Предоставьте источник этой информации, пожалуйста, потому что мои поверхностные знания дают уровень «закомментированности» ДНК человека в 90 раз ниже, чем ваши углубленные.
5. Ориентированность на некие «фразы-маркеры» характеризует круг вашего чтения. Мне вот по вашей ссылке прямо новый мир открылся — никогда в таком значении словосочетание мне раньше не попадалось на глаза.
«Закомментировано» — это вовсе не про метилирование, а просто про тот факт, что постоянно транскрибируются не более 10% генов. А ваши данные про 1% метилированных генов я нисколько не оспариваю. Просто одним метилированием понятие эпигенетики не ограничивается, как вы упорно почему-то настаиваете.
Моя ссылка — это первая страница выдачи гугла. Без обид, может, приведете примеры использования этой фразы в адекватных источниках?
И насчет эпигенетики — вы утверждаете, что это просто раздел генетики, но не приводите источников.
Я могу например вот такой материал привести в качестве упорядоченной статьи об эпигенетике.
while traditional genetics describes the way the DNA sequences in our genes are passed from one generation to the next, epigenetics describes passing on the way the genes are used. To make a computer analogy, think of epigenetics as metadata, information describing and ordering the underlying data..
Но напоследок дарю вам очередное словарное определение:
Эпигенетика
Эпигенетика — в биологии, в частности в генетике — представляет собой изучение закономерностей эпигенетического наследования.
Робин Холлидэй определил эпигенетику как «изучение механизмов временного и пространственного контроля активности генов в процессе развития организмов».
Современное использование этого слова в научном дискурсе является более узким. Греческий префикс epi- в слове, подразумевает факторы, которые влияют «поверх» или «в дополнение к» генетическим, а значит эпигенетические факторы воздействуют вдобавок или помимо традиционных молекулярных факторов наследствености.
Поверхностный обзор это хорошо, но давайте глубже погрузимся в тему.
Интересует детальное описание органелл — их структура, функции, реакции в них проходящие и т.д.
Случайно попалось (или алгоритмы Google проследили за мной).
https://www.youtube.com/watch?v=g39nwNm0Xfw&feature=youtu.be
Краткое введение в Клеточную биологию