У метода есть свои минусы, но при разработке это очень удобно. Хотя, в уже работающем сайте это увеличивает кол-во запросов к серверу. Думаю, решением проблемы будет паковать все скрипты в один файл, после того, как разработка уже завершена.
1. можно через прокси
2. согласен, что отлаживать сложнее, хотя через фаербаг все равно можно. код загружается, возможно, медленнее, но работает впоследствии также
Mohawk / Работа с Аякс