Транзакции в Spring

увы никогда с derby не работал
в любом случае предварительно можно попробовать локализовать проблему:
проверить работают ли транзакции, когда запускаем sql из консольного клиента — такая проблема часто в mysql встречается: пользователь выбрал не тот engine и откат просто не происходит, даже при явном указании rollback