Объясню: Потому что «из коробки» уставнолен apache. Хорошо еще теперь стали nginx ставить. А как говорится: «Работает? Не трогай.». Именно в критических ситуациях и начинаем все менять. таких как эта. На данный момент, заметной нагрузки нет, и тотальная миграция на php-fpm в очередной раз откладывается. Хотя нутром понимаю, что зря.
К сожалению, эти действия были сделаны слишком поздно.