Про то как снять NetFlow с микротика с сохранением трафика на сервере в Инете найти не сложно. Но понадобилось сохранить и содержимое трафика, а вот тут возникли небольшие сложности.
В принципе, про сам режим sniffer'а все очень доступно описано на вики Микротика, сложности возникли с сохранением трафика на внешний сервер.

Дело в том, что перехваченные пакеты микротик готов отправляет на сервер, но инкапсулируя их в протокол Tazmen Sniffer Protocol (TZSP). А вот как потом извлечь их для работы, скажем, с тем же tcpdump'ом, вот это задача. Гугленье показало, что этот протокол "из коробки" понимает Wireshark, но тот же гугл сказал, что Wireshark не сохраняет принятые данные в файл. А это очень нужно было.