Вакуумная камера из алюминиевой фляги

способен нагнетать до 85 кПа ниже атмосферного.

Или нагнетать или ниже атмосферного :)

Посмотрите камеру для дегазации у Негоды. Вы нарушили прочность камеры вырезом для наблюдения. У него прозрачная крышка сверху.

Вероятно, учитывая глубину создаваемого вакуума, следовало выбрать
поликарбонат меньшей толщины, что существенно упростило бы монтаж и
позволило избежать описанных трудностей.

Сила, создаваемая внешним атмосферным давлением на элементы конструкции при вакууме 85 кПа ниже атмосферного, как в статье, лишь на 15% меньше, чем было бы при абсолютном вакууме.

Да, желательно, чтобы кипел. Покипит, вспенится и как выделение нового газа окончено - значит готово.

Можно взять силиконы пожиже, но они менее стойкие в тяготам и невзгодам жизни.

Песец вашей камере. По пунктам:

• Прямоугольный вырез в круглой камере. Именно вырез. Причем "стекло" еще и на болты по периметру.

• Бидон расчитаный под положительное давление, а не отрицательное (направление ребер жесткости, выпуклостей)

• Отверстия под разное в том самом выпуклом дне.

Про вырез тут уже до меня расписали. Дополню только - погуглите за илюминаторы в самолетах и почему при создании "окон" в среде с разностью давления никогда не используют острые углы.

За бидон - ввакум стягивает, он может не сразу, не с первого прогона но гнуть метал. Как мин нужно изнутри ребра жесткости добавить что бы не "скомкало" как пивную банку (не в последнюю очередь из за выреза). Дно еще могло бы держатся, но в нем насверлили отверстий (причем даже не в центре) из за чего каждый ввакум будет "рвать" от точки ослабления геометрии.

В целом лучше бы взяли обычную стальную трубу в 2-4мм и с одной стороны заглушка с вводом из толстой стали, а с другой стороны дверь-окно из толстенного плексиглаза

Просто теоретически:

А нужно-ли это окно вообще?

Не проще ли было поставить компактную камеру и пару полосок светодиодов для освещения?

Компактных камер сейчас полно, а в дальнем верхнем углу вакуумной камеры более чем достаточно места.

...кашу из топора, в которой история началась с неприметного столярного инструмента...

Интересный у Вас столярный арсенал. Раньше топор считался плотницким инструментом. Но результат применения топора, судя по фото, неплохой. А "окно", конечно пугает: размеры Вы не приводите, но с Вашим компрессором ~0,85 кгс/см², посчитайте сколько на него "давит".
И как решили вопрос возврата масла в компрессор? Или просто будете понемногу доливать?