Файловая система lustre — это сложная вещь. Почитайте о её архитектуре.
Фактически она распределяет нагрузку на несколько файл-серверов.
По быстродействию и надежности практически не имеет конкурентов, во всяком случае, в свободном сегменте — она установлена на многих суперкомпьютерах из списка top500. Установить её, мониторить, настраивать — это отдельная деятельность. Можете полистать мануал на 400с.
wiki.lustre.org/index.php/Lustre_Documentation
Насчет операционных систем. Windows отпадает — просто и дешево на ней такую систему вы не построите. Остается Linux. Важно сделать правильный выбор дистрибутива, чтобы потом не пришлось все переделывать.
Наш опыт — использовать RHEL/CentOS/Scientific Linux/Oracle Linux/Springdale Linux
Существует множество программ, которые пишут биоинформатики. Достаточно посмотреть в журнал bioinformatics. Однако при использовнии этих программ приходится все время что-то допиливать, и в любом случае ежедневно писать скрипты для запуска программ, обработки данных и т.д.
Я попросила Сергея прокомментировать. Вот его ответ:
Не совсем ясно, имеется в виду оперативная память, или хранилище.
У российских физиков мне не приходилось видеть узел с RAM 512 GB.
Обычно задачи у них вычислительно-интенсивные, а не требующие большой памяти. Что касается хранилищ, то, ясное дело, данные с коллайдера CERN хранятся по всему миру, объем в петабайтах. Для этого был разработан grid. Здесь речь о другом — об организации датацентра в научной лаборатории биологического профиля, не имеющий IT-отдела. У всех физиков, с которыми мне приходилось общаться, задачи требовали расчетов, а не обработки данных, и, соответственно, получить от них советов по архитектуре датацентра не получилось. Если Вы приведете примеры таких лабораторий, то все биологи с секвенаторами немедленно пойдут к этим физикам за советом.
Файловая система lustre — это сложная вещь. Почитайте о её архитектуре.
Фактически она распределяет нагрузку на несколько файл-серверов.
По быстродействию и надежности практически не имеет конкурентов, во всяком случае, в свободном сегменте — она установлена на многих суперкомпьютерах из списка top500. Установить её, мониторить, настраивать — это отдельная деятельность. Можете полистать мануал на 400с. wiki.lustre.org/index.php/Lustre_Documentation
Насчет операционных систем. Windows отпадает — просто и дешево на ней такую систему вы не построите. Остается Linux. Важно сделать правильный выбор дистрибутива, чтобы потом не пришлось все переделывать.
Наш опыт — использовать RHEL/CentOS/Scientific Linux/Oracle Linux/Springdale Linux
Существует множество программ, которые пишут биоинформатики. Достаточно посмотреть в журнал bioinformatics. Однако при использовнии этих программ приходится все время что-то допиливать, и в любом случае ежедневно писать скрипты для запуска программ, обработки данных и т.д.
Это замечательно, но это другой формат. Нам в ПостНауке важно показывать ученого, делать его публичным персонажем. Если угодно, это такая наука в лицах, которые ее создают. Таким образом, многие ученые, принявшие участие в проекте, стали известны широкой публике, а не только в узком кругу коллег.
Это очень усложнит процесс съемки, кроме того, автор точно не уложится во временные рамки. Ученым только дай волю. А вообще мы думаем над проектом, в котором эксперты иллюстрировали бы самостоятельно свой рассказ, так что возможно в будущем он и появится.
У нас есть в разделе FAQ многие расшифровки видео, дополненные немого потом самими учеными — postnauka.ru/faq
А под видео есть несколько так называемых цитат — три абзаца расшифровок, позволяющих лучше понять суть содержания ролика.
У меня кликабельно. Переходите по ссылке — postnauka.ru/tv/18937 и все должно работать. И там не только про квантовые компьютеры, но и про в принципе про будущее квантовых технологий, а еще съемки в красивой лаборатории.
А вот почитайте, какие проблемы у молодых ученых с получением грантов в России — www.openspace.ru/article/608
Главное, чтобы бюрократия не добралась до краудандинга )
Nickel3000, брала, лично я брала. И описка в фамилии моих рук дело. Вы так не серчайте сразу то. Со всеми бывает, понедельник все-таки :) Сейчас исправим.
Я не отрицаю важность грантов, но, согласитесь, их не очень прозрачная система и излишняя бюрократизация вызывают уныние. И опять же, надо понравится основателю, если это частый фонд. А ученые не всегда хорошо умеют презентовать себя и свое исследование, к сожалению.
Насколько я понимаю, задача краудфандинговых сайтов для науки не в том, чтобы стать полноценной заменой фондам, а чтобы дать дополнительные инструменты и уже готовые решения. Можно писать статьи, посещать конференции и создавать личный сайт, но на него же как-то нужно «пригнать» всех тех ученых, которые вроде как уже принимают участие в вышеописанных в статье сайтах.
Плюсы не только в том, что есть реальная возможность получить деньги на исследование, и пусть не в таком количестве, какое может обеспечить грант, но на свою тему. Как сказано выше, фонды, распределяющие гранты отдают предпочтение глобальным исследованиям, кроме того, приводимые в тексте примеры, относятся больше к естественным наукам, а гуманитариям так вообще живется не сладко, их исследования не нужны почти никому. Вот и гуманитарные вузы у нас теперь признаны не эффективными…
А плюс еще и в интеграции в мировое научное сообщество, так как ученые со всего мира могут увидеть проект, так завязываются знакомства, которые очень важны, так может появится возможность стажировки и практики. Да и просто становится возможным обмен мнений в международной научной среде.
Файловая система lustre — это сложная вещь. Почитайте о её архитектуре.
Фактически она распределяет нагрузку на несколько файл-серверов.
По быстродействию и надежности практически не имеет конкурентов, во всяком случае, в свободном сегменте — она установлена на многих суперкомпьютерах из списка top500. Установить её, мониторить, настраивать — это отдельная деятельность. Можете полистать мануал на 400с.
wiki.lustre.org/index.php/Lustre_Documentation
Насчет операционных систем. Windows отпадает — просто и дешево на ней такую систему вы не построите. Остается Linux. Важно сделать правильный выбор дистрибутива, чтобы потом не пришлось все переделывать.
Наш опыт — использовать RHEL/CentOS/Scientific Linux/Oracle Linux/Springdale Linux
Существует множество программ, которые пишут биоинформатики. Достаточно посмотреть в журнал bioinformatics. Однако при использовнии этих программ приходится все время что-то допиливать, и в любом случае ежедневно писать скрипты для запуска программ, обработки данных и т.д.
Не совсем ясно, имеется в виду оперативная память, или хранилище.
У российских физиков мне не приходилось видеть узел с RAM 512 GB.
Обычно задачи у них вычислительно-интенсивные, а не требующие большой памяти. Что касается хранилищ, то, ясное дело, данные с коллайдера CERN хранятся по всему миру, объем в петабайтах. Для этого был разработан grid. Здесь речь о другом — об организации датацентра в научной лаборатории биологического профиля, не имеющий IT-отдела. У всех физиков, с которыми мне приходилось общаться, задачи требовали расчетов, а не обработки данных, и, соответственно, получить от них советов по архитектуре датацентра не получилось. Если Вы приведете примеры таких лабораторий, то все биологи с секвенаторами немедленно пойдут к этим физикам за советом.
Файловая система lustre — это сложная вещь. Почитайте о её архитектуре.
Фактически она распределяет нагрузку на несколько файл-серверов.
По быстродействию и надежности практически не имеет конкурентов, во всяком случае, в свободном сегменте — она установлена на многих суперкомпьютерах из списка top500. Установить её, мониторить, настраивать — это отдельная деятельность. Можете полистать мануал на 400с.
wiki.lustre.org/index.php/Lustre_Documentation
Насчет операционных систем. Windows отпадает — просто и дешево на ней такую систему вы не построите. Остается Linux. Важно сделать правильный выбор дистрибутива, чтобы потом не пришлось все переделывать.
Наш опыт — использовать RHEL/CentOS/Scientific Linux/Oracle Linux/Springdale Linux
Существует множество программ, которые пишут биоинформатики. Достаточно посмотреть в журнал bioinformatics. Однако при использовнии этих программ приходится все время что-то допиливать, и в любом случае ежедневно писать скрипты для запуска программ, обработки данных и т.д.
А под видео есть несколько так называемых цитат — три абзаца расшифровок, позволяющих лучше понять суть содержания ролика.
Главное, чтобы бюрократия не добралась до краудандинга )
Насколько я понимаю, задача краудфандинговых сайтов для науки не в том, чтобы стать полноценной заменой фондам, а чтобы дать дополнительные инструменты и уже готовые решения. Можно писать статьи, посещать конференции и создавать личный сайт, но на него же как-то нужно «пригнать» всех тех ученых, которые вроде как уже принимают участие в вышеописанных в статье сайтах.
А плюс еще и в интеграции в мировое научное сообщество, так как ученые со всего мира могут увидеть проект, так завязываются знакомства, которые очень важны, так может появится возможность стажировки и практики. Да и просто становится возможным обмен мнений в международной научной среде.