Комментарии 8
В случае коронавируса SARS-CoV-2 таким характерным белком может служить белок SPIKE. В его составе находится домен RBD, который связывается с человеческим белком ACE2, с помощью чего генетический материал вируса попадает в здоровую клетку.
Спайк белок у второго ковида сложно назвать высоко-консервативным. Научные изыскания говорят о как минимум двух фуриновых сайтах рестрикции, где белок режется, получая затем довольно рандомные инсерции. Собственно говоря они признаны «виновниками» высокой афинности к АСЕ2 и как следствие всем тем «нехорошим» что мы наблюдаем.
Вы как то учитываете эту мутагенную область?
Второй вопрос- почему вакцина, почему не МАБ?
Правда, SPIKE не супер-консервативный, но именно он сильнее всего экспонирован на поверхности вируса, а потому является предпочтительной целью для В-клеточного иммунного ответа. Многочисленные секвенирования (придется зарегистрироваться) образцов SARS-CoV-2 из различных пациентов показывают, что текущий мутагенез довольно умеренный и использование RBD оправдано. В случае значительного изменения вируса, конечно, придется делать новую вакцину. Но по накатанным рельсам это может стать рутиной, как ежегодный выпуск противогриппозных вакцин.
Вакцина и моноклональное антитело решают разные задачи. Первая — часть превентивных профилактических мер, второе — уже терапия. Исходный заказ был именно на вакцину. Да и производство антител в требуемых сейчас объемах (если мы говорим о тотальной терапии всех COVID-положительных) задача малореальная. Для тяжелых случаев мы буквально несколько дней назад зарегистрировали anti-IL6R mAb для купирования цитокинового шторма.
на polybasic cleavage site вы вообще не смотрите?
Я не очень понимаю смысла в вакцинации в конкретном случае. Во-первых расходы на вакцинацию существенны, во-вторых для изучения побочных эффектов уйдет время. Время в предыдущих короновирусных инфекциях работало как «лечащий» фактор. Для всех зарегистрированных случаев и не нужны МАБы- только для 10%…
Левилимаб — аналог Tocilizumab?
У нас есть варианты со SPIKE, RBD и эпитопными кассетами. Отдельно PCS не рассматривали как мишень. Но тут не только мы, в целом среди вакцин сейчас наблюдается интерес либо к полноразмерному SPIKE, либо к RBD. Тут же есть еще необходимость у выработавшихся антител сделать препятствие RBD/ACE2 взаимодействия, а посадка антитела в другое место может этого эффекта не вызвать.
Что касается антител, для тяжелых случаев anti-SARS-CoV-2 mAb уже довольно бесполезны, там высокая копийность вируса, да и основные эффекты уже вызваны вторичными причинами. Так что колоть такие антитела имеет смысл как можно раньше, а это выливается в проблемы, о которых я писал. Вакцинация же одних только групп максимального риска (врачи, полиция и т.д.) уже может дать сильный эффект снижения нагрузки на систему.
Левилимаб — оригинальное антитело. У него другая последовательность, ГЛФ и даже способ введения — подкожный. Разработка закончилась уже давно, сейчас активно идет третья фаза в ревматоидном артрите, но вот как жизнь повернулась.
Спасибо за статью!
PS прочитал дальше, вы из применяете.
Стало быть вот чем занимается boinc и f@h ? В разрезе проектов по covid
Только вот на их странице сказано "Targets currently running on World Community Grid
Currently, all computation is focusing on the spike protein of the SARS-CoV2 virus. The first work units targeting the spike were the "stress test," which docked about 300 million small molecules against one of many possible binding sites. Subsequently, we targeted multiple possible binding pockets with both reactive and non-reactive molecules. "
Какие реальные математические задачи возникают при разработке вакцин от COVID-19