В этой статье мы рассмотрим как свернуть одну спираль в РНК. Для понимания нужно прочитать все предыдущие части От белков к РНК, Мат. критерии, Как уменьшить число поворотов цепи?, Как оценить ход сворачивания односпиральной РНК?, Ограничение оптимизирующих методов в играх с противником и без. Если ранее у нас все шло как по маслу, то здесь мы столкнемся с серьезной проблемой. Может кто-то подскажет как её решить.

В недавно вышедшей Visual Studio 11 Beta встроена новая и главная фишка будущего C# 5 — асинхронное программирование с помощью async/await. Про нее уже написано достаточно много статей в том, числе на хабре — например, эта серия статей. Однако, я для себя так и не понял в чем суть нового синтаксиса, пока сам не попробовал его в деле. Данная статья — попытка самому структурировать и до конца разобраться с этим достаточно интересным инструментом и поделиться результатами с сообществом, рассказав про него немного иначе. Итак, поехали…

Целью этой статьи является пошаговая демонстрация процесса разработки всего набора программного обеспечения необходимого для организации связи самодельного устройства с компьютером посредством USB.

На данный момент, большинство радиолюбителей реализуют такой тип подключения используя чипы переходники USB в RS232 таким образом организуя связь со своим устройством посредством драйвера виртуального COM порта поставляемого с чипом переходником. Минусы такого подхода думаю понятны. Это как минимум лишний чип на плате и ограничения накладываемые этим чипом и его драйвером.
Мне же хочется осветить весь процесс организации такого взаимодействия так как оно и должно быть сделано, и как делается во всех серьезных устройствах.
В конце концов, сейчас 21-й век, модуль USB есть почти во всех микроконтроллерах. Именно о том, как наиболее быстро воспользоваться этим модулем и будет эта статья.

Попробовал весьма интересный стартап сервис по приему платежей пластиковыми картами stripe, основанный в Сан-Франциско.



Судя по их блогу, открылись они совсем недавно, если верить информации в интернете, в декабре 2011 года. Примечательно, что среди инвесторов данного сервиса три наиболее влиятельных венчурных фонда силиконовой долины (Sequoia Capital, Y Combinator и Andreessen Horowitz), а также Peter Thiel и Elon Musk, которые являются основателями PayPal. Такая компания инвесторов сразу привлекает внимание к проекту.

Как все прекрасно помнят, на прошедшей IO, Google анонсировал свой Web Store. А для заполнения его представил т.н. web-приложения.
Сегодня речь пойдёт о том, как создать простенькое приложение и подготовится к открытию Web Store.
Для примера будем создавать приложение из ряда Hello World, а именно — калькулятор.

В статье описываются недостатки существующей структуры DNS, полный процесс внедрения DNSSEC на примере доменов .com и .org, процедура создания валидного самоподписанного SSL-сертификата подписанного с помощью DNSSEC.

Уже довольно много времени я работаю в популярной и на мой взгляд лучшей IDE Eclipse. Всегда любил затачивать инструменты под себя, чтобы достичь максимальной производительности, в связи с этим хочу поделится опытом, а именно списком плагинов к eclipse которые использую в повседневной работе.

Введение

Обычно, при оптимизации программы для многоядерных компьютеров первым шагом является выяснение возможности разделения алгоритма на части, выполняющиеся параллельно. Если для решения задачи необходимо параллельно обрабатывать отдельные элементы из большого набора данных, то первыми кандидатами станут новые возможности параллельности в .NET Framework 4: Parallel.ForEach и Parallel LINQ (PLINQ)

Parallel.ForEach

Класс Parallel содержит метод ForEach, представляющий собой многопоточную версию обычного цикла foreach в C#. Подобно обычному foreach, Parallel.ForEach выполняет итерации над перечислимыми данными (enumerable), но с использованием множества потоков. Одна из более часто используемых перегрузок Parallel.ForEach выглядит следующим образом:

public static ParallelLoopResult ForEach<TSource>(
			 IEnumerable<TSource> source,
			 Action<TSource> body)

Ienumerable указывает на последовательность, по которой нужно выполнить итерации, а Action body задает делегат, вызываемый для каждого элемента. Полный список перегрузок Parallel.ForEach можно найти здесь.

PLINQ

Родственный с Parallel.ForEach PLINQ представляет собой модель программирования для паралелльных операций над данными. Пользователь определяет операцию из стандартного набора операторов, включающих в себя проекции, фильтры, агрегирование и т.д. Подобно Parallel.ForEach PLINQ достигает параллельности, разбивая входную последовательность на части и обрабатывая элементы в разных потоках.
В статье выделяются различия между этими двумя подходами к параллельности. Разбираются сценарии использования, в которых лучше всего использовать Parallel.ForEach вместо PLINQ и наоборот.

Выполнение независимых операций

Не так давно промелькнула ссылка на достаточно свежее (осень 2011) англоязычное голосование со скромным названием "самая впечатляющая книга, которую должен прочесть каждый разработчик программного обеспечения" и описанием:

Если бы вы могли вернуться в прошлое, к самому началу своей карьеры разработчика и сказать самому себе: «прочитай именно эту книгу», в самой начале своей карьеры разработчика, какую бы книгу вы рекомендовали?

Тема перевода зарубежной профессиональной IT-литературы стоит достаточно остро, многие любят читать книги в оригинале по различным причинам, таким так время выхода русского перевода с запозданием на годы, недостаточный профессионализм переводчика и соответствующая потеря тонкостей и авторского стиля и т.д.

Однако в данном небольшом посте я возьму на себя смелость перечислить ТОП-5 тех самых книг, победивших в голосовании, переведенных на русский язык. И дать небольшие комментарии, ведь книги действительно этого достойны. Да, лично я бы поменял некоторые места, однако положимся на «мнение зала» ресурса Stack Overflow.

Предисловие

Я уже долгое время ничего не исследую, так сказать ушел на покой. Но тут мне на глаза попалась очередная поделка немало известного в определенных кругах PE_Kill'a. Т.к. мне довелось решать его предыдущую поделку в рамках CRACKL@B Contest 2010, которая в свою очередь была довольно интересна, я решил взглянуть на его новое «детище».

Что вас ждет под катом: подделка CRC32, брут ключа для RC4, факторизация для RSA, а также использование коллизии для MD4 и генерация двух разных сообщений с одинаковыми хешеми. Всё это и многое другое под катом.

Вышла в свет обновленная версия русскоязычной базы данных стран и городов. Основное изменение — удалено большое количество дублей городов.

Является преждевременная оптимизация дорогой в ад? Или подход «потом исправим» превращает программистов из «специалистов» в презираемую всеми «школоту»?

Эти вопросы не имеют четких ответов, тем не менее, в этой статье я постараюсь описать мой собственный подход к производительности. Что я делаю для того, чтобы мои системы работали с приличной скоростью, но не нарушали прочих требований, таких как модульность, сопровождаемость и гибкость.

Замечательная новость для всех flash-разработчиков — буквально пару дней назад вышла финальная версия отличной IDE FlashDevelop 4.0. Те, кто уже знаком с FlashDevelop могут сразу перейти к загрузке новой версии. Остальных хабражителей я приглашаю под кат, чтобы ознакомиться с кратким changelog'ом и описанием основных фич FD4.

В октябре 2011 года профессиональная социальная сеть LinkedIn купила компанию IndexTank, которая занимается производством поисковых технологий. Очевидно, приобретена в первую очередь команда профессионалов под началом известного специалиста Диего Баша (Diego Basch), он же основатель и генеральный директор IndexTank, а в прошлом — один из ведущих разработчиков Inktomi. Как иногда бывает в таких случаях, прошлые продукты компании решили передать в open source. Диего Баш объявил, что исходные коды программного обеспечения IndexTank опубликованы под свободной лицензией Apache 2.0 и выложены на github.

indextank-engine: индексатор
indextank-service: API, BackOffice, Storefront и фреймворк Nebulizer для управления индексами

Поисковый движок IndexTank используется на многих крупных сайтах, в том числе Reddit, Wordpress (плагин для Wordpress) и BitTorrent. Он обеспечивает индексацию контента в реальном времени, поиск с учётом геолокации и т.д.

Программные интерфейсы позволяют разработчикам встраивать поиск IndexTank в свои приложения на Ruby, Java, .NET, Python, PHP и т.д. Документация по API здесь.

Секреты создания CSP для Windows раскрыты в статье Ю.С.Зырянова.

Российские криптоалгоритмы ГОСТ реализованы в OpenSSL Gost.

Удивлен, что на просторах Интернета не удалось найти подтверждения, что кем-то был создан интерфейс криптопровайдера ГОСТ под Windows с использованием вышеприведенных инструментов.

Можно подумать, что эта задача под силу только крупным коммерческим компаниям, имеющим большой опыт в сфере информационной безопасности, к примеру, таким как:

• ООО «Лисси»
• ОАО «ИнфоТеКС»
  
• ЗАО «Сигнал-КОМ»
  
• ОКБ САПР
  
• ну и конечно, ООО «КРИПТО-ПРО»
  

Опровергнуть, хотя бы частично, это утверждение и будет задачей данной статьи.

Введение

Раньше я ни когда не задумывался над разработкой инструментов, упрощающих разработку в Visual Studio, и чаше создавал различные сторонние утилиты для помощи себе в разработке. Но, как обычно бывает, настал переломный момент.
Однажды встала задача разработки платформы, на базе которой надо было бы разрабатывать специализированные решения.
Хотелось максимально упростить разработку решений на платформе, и при этом не урезать возможность гибкой настройки.
Возникло два основных направления решения проблемы:

• Разработать собственные инструменты для создания решений
• Создать вспомогательные средства, встроенные в среду разработки

Сегодня попробую осветить денежные вопросы.
Банковский счет, карты, платежи, PayPal и все такое.
Это продолжение топика HOWTO: свой бизнес в США из России, если кто пропустил.

Решил перевести новость о том, что OpenShift теперь объединяет Jenkins, JBoss Tools и Maven, позволяя Java-разработчикам программировать, собирать, развёртывать и масштабировать приложение в облаке.

Red Hat предлагает вам использовать OpenShift не только для хостинга приложений, но и для всего цикла разработки ПО. Вы можете программировать, компилировать и улучшать своё ПО прямо в «облаке», не используя для этого десктоп или мощный ноутбук.

OpenShift — PaaS-облако, о запуске которого Red Hat объявил в мае. Эта облачная платформа существует в трёх версиях — Express, Flex и Power и позиционируется, как альтернатива Microsoft Azure или Google App Engine. Главное преимущество облачных вычислений состоит в том, что они автоматически масштабируют ресурсы, настолько, насколько это требуется для текущей нагрузки.

Хочу представить вам функцию-конструктор классов createClass.
Чем хорош этот конструктор:
1. Сам код выглядит более читабельным и понятным
2. Поддержка множественного наследования
3. Поддержка абстрактных методов
4. Наследование статических методов и свойств класса
5. Умный метод instanceOf (проверяет по всей цепочке классов)

Приветствую вас, хабражители!

Продолжаю начатое, а именно, пытаюсь рассказать (с применением визуальных образов) о том как реализованы некоторые структуры данных в Java.



В прошлый раз мы говорили об ArrayList, сегодня присматриваемся к LinkedList.

LinkedList — реализует интерфейс List. Является представителем двунаправленного списка, где каждый элемент структуры содержит указатели на предыдущий и следующий элементы. Итератор поддерживает обход в обе стороны. Реализует методы получения, удаления и вставки в начало, середину и конец списка. Позволяет добавлять любые элементы в том числе и null.